Με βάση την ανακοίνωση της εταιρίας, ο λόγος της καθυστέρησης του απόπλου, ήταν το τηλεφώνημα που δέχθηκαν για τοποθέτηση βόμβας στο πλοίο.
Η ανακοίνωση της Ναυτιλιακής Εταιρίας Λέσβου αναφέρει:
«Λόγω τηλεφωνήματος για τοποθέτηση βόμβας στο Ε/Γ-Ο/Γ ΘΕΟΦΙΛΟΣ την Δευτέρα 09/12/2013, σας ενημερώνουμε ότι μετά την ολοκλήρωση του ελέγχου από τη Λιμενική Αρχή Θεσσαλονίκης, το πλοίο αναχώρησε στις 18:00 αντί 15:00, για το τακτικό του δρομολόγιο»
Δεν είναι όμως, η πρώτη φορά που υπάρχει τηλεφώνημα για τοποθέτηση βόμβας στο Θεόφιλος, αφού και στις 16 Αυγούστου του 2002, πλήρωμα και επιβάτες αναστατώθηκαν απο παρόμοιο άκουσμα.
Το δημοσίευμα της Ναυτεμπορικής, ανέφερε τότε:
Τηλεφώνημα αγνώστου, καθυστέρησε κατά μία περίπου ώρα τον απόπλου του επιβατηγού -οχηματαγωγού πλοίου «Θεόφιλος», το οποίο με περίπου χίλιους επιβάτες και δεκάδες αυτοκίνητα, ετοιμαζόταν να αποπλεύσει από το λιμάνι του Πειραιά για Χίο - Μυτιλήνη, Λήμνο - Θεσσαλονίκη.
Ο άγνωστος άνδρας, τηλεφώνησε λίγο πριν τις 19:00 στο Α' Λιμενικό Τμήμα και ανέφερε την ύπαρξη βόμβας στο πλοίο της ΝΕΛ.
Αμέσως απαγορεύθηκε ο απόπλους, οι επιβάτες αποβιβάσθηκαν, και οι άνδρες του κλιμακίου ειδικών αποστολών του Λιμενικού Σώματος με τη βοήθεια δύο σκύλων άρχισαν να ερευνούν όλα τα σημεία του πλοίου.
Αξιωματικοί του Λιμενικού Σώματος εκτιμούν ότι πρόκειται για φαρσέρ. Το «Θεόφιλος» απέπλευσε στις 20.10.
