Η αναστολή λειτουργίας κρίθηκε αναγκαία εξαιτίας των κτιριολογικών βελτιώσεων που θα πραγματοποιηθούν στο πλαίσιο του έργου «Εκσυγχρονισμός Αρχαιολογικού Μουσείου Λήμνου», το οποίο είναι ενταγμένο στο επιχειρησιακό πρόγραμμα ‘Βόρειο Αιγαίο 2014-2020’.